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中心针对生物信息学的多学科、多技术系统集成的特点，充分发挥生物信息学科综合性强的优势，以重要关键技术平台建设和生物医学信息学研究为主线，培育和不断发展生物信息学研究的优势团队。目前，中心已拥有固定员工70余名，研究团队中，高级职称15人，中级职称30人，主要研发骨干都是留学回国人员。其中，两位首席科学家均为美、英著名大学的终身教授。国内外著名大学博士人才达到17人，硕士12人，本科33人。目前中心联合培养的生物信息技术博士、硕士研究生已超过了30人。中心日常工作和开发人员已经超过90人。
中心主任李亦学教授是留学归国专家，德国海德堡大学理论物理博士和欧盟分子生物学实验室生物物理博士后，现为国家“十五”高技术发展计划（863计划）生物和农业技术领域生物信息工程技术主题专家组组长，曾任国家中长期规划科技条件平台专题组（第十五组）副组长，获得上海市领军人人才基金。中心副主任钟扬教授，复旦大学生命学院常务副院长。中心副主任谭瑞琮，具有工商管理硕士学位（MBA），是具有专业学识背景的复合型管理人员。中心副主任戴建凉，曾为联合基因科技集团联众基因研究院总工程师，具有丰富的生物信息工程技术与产品开发、技术服务与企业管理经验。中心副主任刘雷，美国伊利诺伊大学博士，助教授，动物学系生物信息技术中心主任。
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